学校理工科拥有2个国家重点实验室，1个国家工程技术研究中心，1个国家野外科学观测研究站，1个国家级国际联合研究中心，7个教育部重点实验室和工程研究中心，1个教育部国际合作联合实验室，1个教育部战略研究基地和高等学校软科学研究基地，1个教育部野外科学观测研究站，1个民政部研究中心，1个国家新闻出版署重点实验室，2个自然资源部重点实验室和工程技术创新中心，12个上海市重点实验室和工程技术研究中心，1个上海市工程研究中心，1个上海市野外科学观测研究站，1个上海市软科学研究基地，1个上海市协同创新中心；学校文科拥有6个教育部人文社会科学重点研究基地，1个国家教材建设重点研究基地，7个教育部国别和区域研究中心，1个全国普通高校中华优秀传统文化传承基地，7个上海市哲学社会科学创新研究基地，6个上海市人民政府决策咨询研究基地工作室，4个上海高校智库，1个中国老龄协会老龄科研基地，10个上海高校“立德树人”人文社会科学重点研究基地，1个上海高校中华优秀传统文化基地。现有基础学科拔尖学生培养计划2.0基地10个，国家级实验教学示范中心2个，国家级虚拟仿真实验教学中心1个，上海市实验教学示范中心9个。学校主办、承办和合办各类中文期刊23种、英文期刊7种，两校区图书馆馆藏印刷型文献总量486.67万余册、各类电子文献数据库161个（462个子库）。学校成立教育集团，现有自办与合作举办的附属中小学、幼儿园共58所（正式招生办学）。学校继续教育坚持管办分离，积极对接国家战略，探索培育高品质非学历教育项目，注重推进内涵式发展，统筹提升社会效能和经济效能。
学校注重国际合作交流，先后与里昂高师等法国三所高等师范学院、美国纽约大学、弗吉尼亚大学、加拿大不列颠哥伦比亚大学、俄罗斯莫斯科罗蒙诺索夫国立大学、圣彼得堡理工大学、澳大利亚昆士兰大学、日本东京大学等世界著名大学建立了紧密合作关系，与世界300余所高校和科研机构签订了学术合作与交流协议。与里昂高师等法国三所高等师范学院成立中法联合研究生院；与法国里昂高师和法国国家科学研究中心成立中法社会与科学联合研究院；与美国纽约大学联合创办的上海纽约大学，是第一所具有独立法人资格的中美合作创办的大学；与法国里昂商学院合作共建亚欧商学院；与以色列海法大学合作共建转化科学与技术联合研究院；与加拿大阿尔伯塔大学共建先进科学与技术联合研究院。学校设有国际汉语教师研修基地，作为中方合作院校建设4所孔子学院和2所独立孔子课堂。
