人才培养：学校是国家13所试办八年制医学教育的高等院校之一，也是唯一一所开设八年制医学教育的独立医科院校，全国首批“卓越医生教育培养”试点高校。“基础医学拔尖学生培养基地”入选国家基础学科拔尖学生培养计划2.0基地。与世界21个国家和地区的63所知名高校、医疗及研究机构建立了友好关系。先后获国家级教学成果奖10项，省级教学成果奖41项。近年来，本科毕业生中先后涌现出侯凡凡、夏照帆等多名两院院士。全国执业医师资格考试中，临床医学通过率最高排名全国第4，中医学3次排名全国第1。2017年本科生获全国临床技能大赛一等奖，在“挑战杯”系列竞赛中获国家级奖项28项，其中连续五届获创业计划大赛（“小挑”）国赛金奖7项；获学术科技作品竞赛（“大挑”）国赛特等奖1项，一等奖4项。“挑战杯”系列竞赛成绩多年来稳居全国医药类高校前两位。2015年以来，先后有2人获“中国大学生年度人物”入围奖，6人获评“广东省大学生年度人物”或提名。
师资队伍：学校现有国家级人才项目入选者239人次，省级人才项目入选者354人次，其中：两院院士3人、双聘院士6人，国家级教学团队3个，国家教学名师4人，国家海外高层次人才15人，*21人，国家杰青19人，国家特支计划12人（青年拔尖人才3人），“百千万人才工程”国家级人选20人，科技部中青年科技创新领军人才6人，国家“优青”13人。
科学研究：学校共有国家重点实验室、国家临床医学研究中心、粤港澳大湾区脑与类脑研究中心等国家和省部级科研平台93个，科技部重点领域创新团队2个、教育部创新团队2个、国家自然科学基金创新研究群体1个。共获国家科技三大奖18项，省部级一等奖55项，获国家科技奖数量位居广东省属高校第一。连续三个五年计划牵头承担传染病防治国家科技重大专项。2021年获国家自然基金309项，立项数居全国独立医科院校第2位，连续6年跻身全国30强。《南方医科大学学报》入选“中国科技期刊卓越行动计划”梯队期刊类项目，连续8年获得“百种中国杰出学术期刊”称号，综合评价得分位列全国医药大学学报类期刊第1位。
医疗实力：现有13所直属附属医院，共展开床位13000余张，年诊疗服务1500万余人次。拥有国家临床重点专科17个，国家中医药管理局重点专科（病）4个，广东省临床重点专科60个，广东省高水平临床重点专科35个、广东省医疗质量控制中心13个，建成广东省肾脏病研究所、广东省肝脏疾病研究所、广东省骨科研究院、广东省口腔医学研究院。南方医院、珠江医院入选广东省高水平医院建设“登峰计划”。南方医院牵头建设国家创伤区域医疗中心、国家区域中医（风湿病科）诊疗中心，入选国家疑难病症诊治能力提升工程。中西医结合医院入选国家中医药传承创新工程项目。
