目前，复旦大学有直属院（系）35个，附属医院18家（其中4家筹建）。学校设有本科专业79个，拥有一级学科博士学位授权点37个，一级学科硕士学位授权点43个（含一级学科博士学位授权点），博士专业学位授权点4个，硕士专业学位授权点32个，博士后科研流动站35个。在校普通本、专科生13991人，研究生22232人（含全日制和非全日制的大陆港澳台生），学历留学生2946人。在校教学科研人员3139人。中国科学院、中国工程院院士（含双聘）51人，文科杰出教授1人，文科资深教授13人，国家杰出青年科学基金118人，国家各类重要青年人才计划入选者301人次。
在QS世界大学排名中列全球第40位，复旦大学位列国内高校第3位。在学术影响力方面，复旦进入ESI世界前1%的学科领域数19个，位列中国大陆高校第2名（并列），其中，化学、材料科学、临床医学、药理学与毒理学进入全球1‰。在QS世界学科排名中，复旦有29个学科位列世界前100，总量在国内排名第三；五大学科门类均位居全球前100位，在中国大陆地区仅二所高校跻身此列。U.S.News世界学科排名中，有4个学科跻身世界前50，THE泰晤士高等教育世界学科排名中，1个学科大类跻身世界前50。在全国第四轮一级学科评估中，5个学科获评A+，参评的学科中60%以上获评A类学科。此外有14个学科入选上海市高峰学科建设。
学校有国家重点实验室5个，国家数学中心1个，国家教材建设重点研究基地1个，国家临床医学研究中心2个，国家制造业创新中心1个，教育部工程研究中心7个，教育部重点实验室14个，卫健委重点实验室9个，总后勤保障部卫生部重点实验室1个，上海市重点实验室15个，上海市工程研究中心11个；有教育部人文社会科学重点研究基地10个，中国研究院入选首批国家高端智库建设试点单位，马克思主义学院入选首批全国重点马克思主义学院，“中国大学智库论坛”秘书处落户复旦。
近年来，复旦大学同全球40多个国家和地区的270多所大学和机构签订有合作协议，师生每年出国约8000人次，每年接受海外来访人员约5000人次，每年举办国际会议约100场。
学校共有邯郸、枫林、张江、江湾四个校区，占地总面积约243.92万平方米，校舍建筑面积224.11万平方米。（数据截止日期2020年4月）
